Ingénieur en Bioinformatique (H/F)

Portail > Offres > Offre UMR6293-HEISER-004 - Ingénieur en Bioinformatique (H/F)Ingénieur en Bioinformatique (H/F)Cette offre est disponible dans les langues suivantes :Date Limite Candidature : vendredi 25 octobre 2024 23:59:00 heure de ParisAssurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler.Informations généralesIntitulé de l'offre : Ingénieur en Bioinformatique (H/F)Référence : UMR6293-HEISER-004Nombre de Postes : 1Lieu de travail : CLERMONT FERRANDDate de publication : vendredi 4 octobre 2024Type de contrat : CDD Technique/AdministratifDurée du contrat : 13 moisDate d'embauche prévue : 18 novembre 2024Quotité de travail : Temps completRémunération : A partir de 2847 € brut mensuel selon expérienceNiveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)Expérience souhaitée : IndifférentBAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnementEmploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de donnéesMissionsNous recherchons un bioinformaticien très motivé pour travailler sur le projet ERC MeioPoly, qui vise à élucider les mécanismes de l'adaptation méiotique à l'allopolyploïdie. L'hybridation entre espèces apparentées conduit à la formation d'organismes allopolyploïdes confrontés à des changements génomiques, épigénomiques et transcriptomiques qui doivent être surmontés pour que cette nouvelle espèce survive. La recombinaison méiotique entre les sous-génomes (hérités des progéniteurs) peut conduire à des réarrangements génomiques hautement délétères et doit être évitée. En utilisant l'allotétraploïde Arabidopsis suecica comme modèle, le projet MeioPoly a pour objectif de décrypter les processus évolutifs permettant la stabilisation méiotique des jeunes allopolyploïdes.Le candidat retenu développera des outils informatiques pour caractériser les variations génétiques, les réarrangements chromosomiques, ainsi que les changements épigénomiques et transcriptomiques pour élucider les bases de la stabilité méiotique et de la fertilité des allopolyploïdes naissants.Activités- Développement de pipelines pour répondre aux questions biologiques posées- Analyse de données NGS (RNA-seq, ChIP-seq...)- Mise en forme des données en vue de l'écriture de publicationsCompétencesLes candidats doivent être titulaires d'un Master II ou d'un doctorat en bioinformatique.- Capacité à développer des méthodes et des pipelines pour analyser, gérer et interpréter des jeux de données biologiques- Excellentes compétences en programmation et solides capacités d'analyse et de résolution de problèmes- Expertise en séquençage long reads (ONT), ChIP-seq et RNA-seq- Capacité à travailler de manière autonome et en coopération avec les autres membres de l'équipe- Maîtrise de l'anglais scientifiqueContexte de travailLa personne recrutée rejoindra l’équipe « Recombinaison et maintenance de l’intégrité du génome » de l’iGReD (Institut de Génétique, Reproduction et Développement) à Clermont-Ferrand en France. Les 15 équipes de recherche de l’iGReD ont pour objectif de comprendre les programmes génétiques et épigénétiques associés à la reproduction et au développement normal et pathologique, et fournissent un environnement scientifique dynamique et coopératif.Contraintes et risquesn.a.Informations complémentairesLa date d'embauche est flexible (mi-novembre 2024 à février 2025).La durée du contrat est de 13 mois, renouvelable deux fois. #J-18808-Ljbffr